五味子苗期管理是农业生产中的重要环节，是获得果实的关键决定因素。正确的苗期管理将大大提高果实的品质，提高苗床和果园的效益。
五味子苗期管理主要应注意提高栽培环境的质量和改善栽培技术。首先，需要选择适宜的苗圃，保持苗圃土壤肥沃、湿润、气候温和，避免盐分过高等对苗种的不利影响。其次，应选择优质的种苗，保障栽培时苗种的活力，也可以提前建立苗圃，促进苗种的活力充分发挥，让种苗在之后的栽培中发挥更高的效果。
另外，五味子的苗期管理也应注重施肥。撒五味子种子前，应充分施肥，利用腐熟的粪肥，用缓冲介质对苗圃给予能量；苗期浇灌，应保持苗圃湿润，而不要把苗圃浇得太多，以免水土分流，影响园土的品质；还应根据实际情况，选择合适的施药方案，加强非生物防控，有效防止病虫害和其他有害物质影响苗种的生长。
此外，五味子苗期管理还应注意生物防控。生物杀虫的方式，可用打害虫网等方式操作，在中空的管道中注入小蝇等，从而杀死病虫害；次要通过植物搭配，减少病虫害，也可以确保苗圃中的植物多样性，改善苗圃环境，抑制病虫害对五味子苗种的影响。