李子树发芽后死亡的原因可能有很多，主要可能与以下因素有关：
1. 水分不足。如果土壤干燥，李子树就无法从土壤中吸收到充足的水分，导致树体失水，发芽后无法生长健壮，最终死亡。
2. 高温干旱。如果环境温度太高，气候干旱，就会使李子树发芽后无法承受高温和干旱的压力，导致树叶枯萎、死亡。
3. 病虫害。如果李子树叶片上受到了虫害或病菌侵袭，就会破坏树叶的正常生长和发育，导致发芽后的李子树叶片逐渐萎黄，并最终死亡。
4. 土壤质量问题。如果土壤中存在过多的化学肥料、杂质或是酸碱度过高或缺乏养分，就会影响到树体生长和发育，导致发芽后的李子树无法正常生长，最终死亡。
5. 错误的剪枝和修剪。如果在生长期间进行错误的剪枝和修剪，就会使得李子树生长过于缓慢，无法及时修复伤口，导致继续生长时受到更多的伤害而死亡。
综上所述，李子树发芽后死亡的原因可能是多方面的，如果要从根本上避免这种情况的发生，就应该从土壤养护、适宜温度和湿度、病虫害防治等方面入手，保证李子树在发芽后能够顺利地生长发育。